Das Collegium Carolinum veranstaltet regelmäßig im Herbst seine Jahrestagung, auf der es sich jeweils einem Schwerpunktthema zur Geschichte der böhmischen Länder sowie in vergleichender Perspektive anderen Staaten des östlichen Mitteleuropa widmet. In der Reihe Bad-Wiesseer Tagungen des Collegium Carolinum werden die Beiträge der Jahrestagungen publiziert.