Das Collegium Carolinum organisiert regelmäßig Veranstaltungen wie Konferenzen, Workshops oder Vorträge. Neben den zahlreichen Einzelvorträgen und -veranstaltungen stechen die traditionsreichen Jahrestagungen des Instituts und die "Informationsbörse" Bohemisten-Treffen heraus. Das Collegium Carolinum ist darüber hinaus auch in der universitären Lehre engagiert.